Het NiNsee werkt nauw samen met vele partners; van grote en kleinere culturele instellingen in Nederland tot de lokale grassroots organisaties. Met name de landelijke NiNsee Comités vervullen een directe en onmisbare rol bij het uitdragen van de waarden en doelstellingen van het NiNsee. Ook dragen ze bij aan de verschillende activiteiten die het NiNsee jaarlijks programmeert.